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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Epagri-Sede. |
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Data corrente: |
16/11/2017 |
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Data da última atualização: |
16/11/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ROCHA, D. F. O.; CUNHA, C. M. S.; BELAZ, K. R. A.; SANTOS, F. N.; HINZ, R. H.; PEREIRA, A.; WICKERT, E.; ANDRADE, L. M.; NASCIMENTO, C. A. O.; VISCONTI, A.; EBERLIM, M. N. |
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Título: |
Lipid and protein fingerprinting for Fusarium oxysporum f. sp. cubense strain-level classification. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Analytical and Bioanalytical Chemistry, Germany, v. 409, n. 29, p. 6803-6812, 2017. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Banana is one of the most popular fruits in the world but has been substantially impaired by Panama disease in the last years. Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc) is the causal agent and colonizes banana cultivars from many subgroups with different aggressiveness levels, often leading to plant death while compromising new crops in infested areas. This study has evaluated the ability of MALDI-MS protein and lipid fingerprinting to provide intraspecies classification of Foc isolates and to screen biomolecules related to host-pathogen relationship. The MS data, when inspected via partial least square discriminant analysis (PLS-DA), distinguished the isolates by aggressiveness as well as by specific location and host. Although both lipids and proteins show discriminating tendencies, these differences were more clearly perceived via the protein profiles. Considering that Cavendish cultivar is the more resistant option to endure Foc presence in the field, the lipids and proteins related to this subgroup might have an important role in pathogen adaptation. This study reports a new application of MALDI-MS for the analysis of a banana pathogen with intraspecies classification ability. |
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Palavras-Chave: |
LMW proteins; MALDI-MS; Microbial classification; Multivariate statistical analysis; Phospholipids; Phytopathogen. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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Marc: |
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005 2017-11-16
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520 $aBanana is one of the most popular fruits in the world but has been substantially impaired by Panama disease in the last years. Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc) is the causal agent and colonizes banana cultivars from many subgroups with different aggressiveness levels, often leading to plant death while compromising new crops in infested areas. This study has evaluated the ability of MALDI-MS protein and lipid fingerprinting to provide intraspecies classification of Foc isolates and to screen biomolecules related to host-pathogen relationship. The MS data, when inspected via partial least square discriminant analysis (PLS-DA), distinguished the isolates by aggressiveness as well as by specific location and host. Although both lipids and proteins show discriminating tendencies, these differences were more clearly perceived via the protein profiles. Considering that Cavendish cultivar is the more resistant option to endure Foc presence in the field, the lipids and proteins related to this subgroup might have an important role in pathogen adaptation. This study reports a new application of MALDI-MS for the analysis of a banana pathogen with intraspecies classification ability.
653 $aLMW proteins
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773 $tAnalytical and Bioanalytical Chemistry, Germany$gv. 409, n. 29, p. 6803-6812, 2017.
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Registro original: |
Epagri-Sede (Epagri-Sede) |
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Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Epagri-Sede. |
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Data corrente: |
25/06/2014 |
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Data da última atualização: |
25/06/2014 |
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Tipo da produção científica: |
Comunicado Técnico |
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Autoria: |
LICHTEMBERG, L. A.; SONEGO, M.; NEGREIROS, R. J. Z.; PERUCH, L. A. M.; HINZ, R. H.; MILANEZ, J. M.; ANDREOLA, F. |
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Título: |
Banana. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
In: EPAGRI. Avaliação de cultivares em Santa Catarina 2013-2014. Florianópolis, SC: Epagri, 2013. |
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Páginas: |
5 p. |
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Série: |
(Epagri. Boletim Técnico, 162). |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
No trabalho são apresentadas características das plantas, componentes da produção, suscetibilidade às pragas e doenças da cultura, tolerância às intempéries climáticas, de diversas cultivares de bananeira avaliadas, no Litoral Norte e Sul de Santa Catarina. São apresentados dados das cultivares: Branca, SCS451 Catarina, Prata Anã, Pacovan, SCS452 Corupá, Grande Naine, Nanicão, IAC-2001, Williams, Nam, Buccaneer, BRS Tropical, BRS Fhia Maravilha, BRS Platina, Pacovan Ken, Preciosa, Japira, Prata Graúda e Thap Maeo. |
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Palavras-Chave: |
Banana; Musa spp; Resistência varietal; Subgrupo Cavendish; Subgrupo Prata; Variedade. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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Marc: |
LEADER 01325naa a2200289 a 4500
001 1121162
005 2014-06-25
008 2013 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aLICHTEMBERG, L. A.
245 $aBanana.$h[electronic resource]
260 $c2013
300 $a5 p.
490 $a(Epagri. Boletim Técnico, 162).
520 $aNo trabalho são apresentadas características das plantas, componentes da produção, suscetibilidade às pragas e doenças da cultura, tolerância às intempéries climáticas, de diversas cultivares de bananeira avaliadas, no Litoral Norte e Sul de Santa Catarina. São apresentados dados das cultivares: Branca, SCS451 Catarina, Prata Anã, Pacovan, SCS452 Corupá, Grande Naine, Nanicão, IAC-2001, Williams, Nam, Buccaneer, BRS Tropical, BRS Fhia Maravilha, BRS Platina, Pacovan Ken, Preciosa, Japira, Prata Graúda e Thap Maeo.
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700 1 $aNEGREIROS, R. J. Z.
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700 1 $aMILANEZ, J. M.
700 1 $aANDREOLA, F.
773 $tIn: EPAGRI. Avaliação de cultivares em Santa Catarina 2013-2014. Florianópolis, SC: Epagri, 2013.
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Registro original: |
Epagri-Sede (Epagri-Sede) |
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