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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Epagri-Sede. |
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Data corrente: |
23/11/2020 |
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Data da última atualização: |
23/11/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
KLABUNDE, G. H. F.; PEREIRA, A.; NORA, I. |
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Título: |
PADRONIZAÇÃO E VALIDAÇÃO DE PROTOCOLO PARA DNA BARCODING DEÁCAROS (ARACHNIDA). |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 6., 2020, Online. Resumos... Brasília: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2020. p. 1-2. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A correta identificação de ácaros, predadores e pragas, é de extrema importância para a aplicação eficaz dos ácaros predadores como recurso genético e alternativa visando o controle biológico de ácaros-praga em diversas culturas. Em determinadas situações, o uso de caracteres morfológicos é insuficiente para a identificação taxonômica de ácaros. O emprego da técnica de DNA barcoding, baseada no gene mitocondrial Citocromo oxidase, sub-unidade 1 (CO1),permite a identificação precisa das espécies, em complemento aos caracteres morfológicos. Este trabalho objetivou padronizar um protocolo econômico e eficaz de isolamento de DNA e posterior amplificação, sequenciamento do geneCO1 e validação da técnica de DNA barcoding em amostras de ácaro rajado (Tetranychus urticae
). Foram aplicados quatro métodos distintos de obtenção dos ácaros para isolamento de DNA, sendo: (I) Ácaros estocados em álcool 70%,filtrados em filtro de gramatura 80g/m2 e coletados úmidos; (II) Ácaros estocados em álcool 70%, filtrados em filtro de gramatura 80g/m2 e coletados secos overnight; (III) Ácaros estocados em álcool 70%, filtrados em membrana em bomba de vácuo e coletados secos; (IV) Ácaros coletados vivos e acondicionados diretamente em tampão de extração. Nos métodos, I, II e III as amostras foram lavadas 5 vezes em água ultra pura antes das filtrações. O método in house deisolamento de DNA testado foi baseado em proteinase K, alta concentração salina e SDS. O DNA total das extrações foi quantificado via espectrofotometria. Os métodos I e II apresentaram ótima quantidade de DNA isolado, sendo 229 e 682ng/μl, respectivamente. Já os métodos III e IV apresentaram baixas concentrações de DNA total, sendo 3 e 2 ng/μl,respectivamente. O gene mitocondrial Citocromo oxidase, sub-unidade 1 teve sua região parcial amplificada via PCR com o uso dos iniciadores Lep1F e Lep1R. - A banda alvo de 653 pb amplificou em todos os métodos com exceção do método III. Os produtos de PCR foram purificados e sequenciados bidirecionalmente via eletroforese capilar na plataforma ABI 3500. Os eletroferogramas foram analisados e a sequência consenso final foi submetida a uma análise de BLASTn na plataforma NCBI. O resultado da análise de BLASTn para todas as amostras retornou Tetranychus urticae como resultado, com 100% de identidade e E-value de zero. Os resultados indicam os métodos I e II como ideais para o isolamento de DNA de ácaro para posterior amplificação e sequenciamento da região barcode. MenosA correta identificação de ácaros, predadores e pragas, é de extrema importância para a aplicação eficaz dos ácaros predadores como recurso genético e alternativa visando o controle biológico de ácaros-praga em diversas culturas. Em determinadas situações, o uso de caracteres morfológicos é insuficiente para a identificação taxonômica de ácaros. O emprego da técnica de DNA barcoding, baseada no gene mitocondrial Citocromo oxidase, sub-unidade 1 (CO1),permite a identificação precisa das espécies, em complemento aos caracteres morfológicos. Este trabalho objetivou padronizar um protocolo econômico e eficaz de isolamento de DNA e posterior amplificação, sequenciamento do geneCO1 e validação da técnica de DNA barcoding em amostras de ácaro rajado (Tetranychus urticae
). Foram aplicados quatro métodos distintos de obtenção dos ácaros para isolamento de DNA, sendo: (I) Ácaros estocados em álcool 70%,filtrados em filtro de gramatura 80g/m2 e coletados úmidos; (II) Ácaros estocados em álcool 70%, filtrados em filtro de gramatura 80g/m2 e coletados secos overnight; (III) Ácaros estocados em álcool 70%, filtrados em membrana em bomba de vácuo e coletados secos; (IV) Ácaros coletados vivos e acondicionados diretamente em tampão de extração. Nos métodos, I, II e III as amostras foram lavadas 5 vezes em água ultra pura antes das filtrações. O método in house deisolamento de DNA testado foi baseado em proteinase K, alta concentração salina e SDS. O DNA total das extrações foi quantificado... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Acari; Barcode Index Number; CO1. |
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Categoria do assunto: |
O Insetos e Entomologia |
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Marc: |
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653 $aAcari
653 $aBarcode Index Number
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700 1 $aNORA, I.
773 $tIn: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 6., 2020, Online. Resumos... Brasília: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2020. p. 1-2.
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Registro original: |
Epagri-Sede (Epagri-Sede) |
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| Registros recuperados : 186 | |
| 181. |  | PUCCI, A. A.; CORDOVA, U. A.; M.B.F.SCHLICKMANN, A. F.; SCHLICHTING, A. P.; NUNES, I. R.; SOUZA, L. T.; SOUZA, N. G.; JESUS, N. N.; PEREIRA NETO, S. O processo de fabricação do queijo artesanal serrano no Planalto Sul de Santa Catarina. In: SIMPÓSIO QUEIJOS ARTESANAIS DO BRASIL - DIVERSIDADE, QUALIDADE E IDENTIDADE, 2., 2013, Porto Alegre, RS. [Resumos...]. Porto Alegre, RS: Emater - RS, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Epagri-Sede. |
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| 182. | | CORDOVA, U. A.; M.B.F.SCHLICKMANN, A. F.; PUCCI, A. A.; SCHLICHTING, A. P.; COUTO, C. A. L.; NUNES, I. R.; SOUZA, L. T.; SOUZA, N. G.; JESUS, N. N.; PEREIRA NETO, S. Queijo artesanal serrano - História, cultura e geração de renda nos campos de altitude do Sul do Brasil. Florianópolis, SC: Epagri, 2013. 8 p.| Tipo: Folder/Folheto/Cartilha |
| Biblioteca(s): Epagri-Sede. |
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| 184. | | M.B.F.SCHLICKMANN, A. F.; CORDOVA, U. A.; PUCCI, A. A.; SCHLICHTING, A. P.; NUNES, I. R.; SOUZA, L. T.; SOUZA, N. G.; JESUS, N. N.; PEREIRA NETO, S. O resgate da história do queijo artesnal serrano em Santa Catarina. In: SIMPÓSIO DE QUEIJOS ARTESANAIS DO BRASIL - DIVERSIDADE, QUALIDADE E IDENTIDADE, 2., 2013, Porto Alegre, RS. [Resumos...]. Porto Alegre, RS: Emater - RS, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Epagri-Sede. |
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| 185. | | CORDOVA, U. A.; PUCCI, A. A.; M.B.F.SCHLICKMANN, A. F.; SCHLICHTING, A. P.; NUNES, I. R.; SOUZA, L. T.; SOUZA, N. G.; JESUS, N. N.; PEREIRA NETO, S. O sistema de produção utilizado pelos produtores de queijo artesanal serrano no Planalto Sul de Santa Catarina. In: SIMPÓSIO DE QUEIJOS ARTESANAIS DO BRASIL - DIVERSIDADE, QUALIDADE E IDENTIDADE, 2., 2013, Porto Alegre, RS. [Resumos...]. Porto Alegre, RS: Emater - RS, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 186. | | CORDOVA, U. A.; PUCCI, A. A.; M.B.F.SCHLICKMANN, A. F.; SCHLICHTING, A. P.; NUNES, I. R.; SOUZA, L. T.; SOUZA, N. G.; JESUS, N. N.; PEREIRA NETO, S. O sistema de produção utilizado pelos produtores de Queijo Artesnal Serrano no Planalto Sul de Santa Catarina. In: SIMPÓSIO DE QUEIJOS ARTESANAIS DO BRASIL, 1., 2011, Fortaleza, SC. [Anais...]. Fortaleza, CE: Embrapa Agroindústria Tropical, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
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