| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Epagri-Sede. Para informações adicionais entre em contato com biblio@epagri.sc.gov.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Epagri-Sede. |
|
Data corrente: |
19/03/2012 |
|
Data da última atualização: |
19/03/2012 |
|
Autoria: |
NASCIMENTO, M. ; SÁFADI, T.; SILVA, F. F. e. |
|
Título: |
Aplicação da análise de agrupamento de dados de expressão gênica temporal a dados em painel. |
|
Ano de publicação: |
2011 |
|
Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v. 46, n. 11, p. 1489-1495, nov. 2011. |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi determinar a melhor alternativa, entre os métodos de agrupamento hierárquico (Ward) e de otimização (Tocher), para a formação de grupos homogêneos de séries de expressão gênica, e realizar previsões quanto à expressão gênica dessas séries, a partir de pequeno número de observações temporais. Os dados utilizados referem-se à expressão de genes que atuam sobre o ciclo celular de Saccharomyces cerevisiae e corresponderam a 114 séries de expressão gênica, cada uma com dez valores de "fold-change" (medida da expressão gênica) ao longo do tempo (0, 15, 30, 45, 60, 75, 90, 105, 120 e 135 min). As estimativas dos parâmetros dos modelos autorregressivos AR(p) foram previamente ajustadas a séries individuais (de cada gene) de dados "microarray time series" e utilizadas, como variáveis, no processo de agrupamento. As previsões da expressão gênica foram feitas dentro de cada grupo formado, a partir dos ajustes no modelo AR(p) para dados em painel. O método de Ward foi o mais apropriado para a formação de grupos de genes com séries homogêneas. Uma vez obtidos esses grupos, é possível ajustar o modelo AR(2) para dados em painel e predizer a expressão gênica em um tempo futuro (135 min), a partir de um pequeno número de observações temporais (os outros nove valores de "fold-change"). |
|
Palavras-Chave: |
Bioinformática; Método de Tocher; Método de Ward; Microarranjo; Modelo autorregressivo; Série temporal. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
Marc: |
LEADER 02026naa a2200217 a 4500
001 1083874
005 2012-03-19
008 2011 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aNASCIMENTO, M.
245 $aAplicação da análise de agrupamento de dados de expressão gênica temporal a dados em painel.
260 $c2011
520 $aO objetivo deste trabalho foi determinar a melhor alternativa, entre os métodos de agrupamento hierárquico (Ward) e de otimização (Tocher), para a formação de grupos homogêneos de séries de expressão gênica, e realizar previsões quanto à expressão gênica dessas séries, a partir de pequeno número de observações temporais. Os dados utilizados referem-se à expressão de genes que atuam sobre o ciclo celular de Saccharomyces cerevisiae e corresponderam a 114 séries de expressão gênica, cada uma com dez valores de "fold-change" (medida da expressão gênica) ao longo do tempo (0, 15, 30, 45, 60, 75, 90, 105, 120 e 135 min). As estimativas dos parâmetros dos modelos autorregressivos AR(p) foram previamente ajustadas a séries individuais (de cada gene) de dados "microarray time series" e utilizadas, como variáveis, no processo de agrupamento. As previsões da expressão gênica foram feitas dentro de cada grupo formado, a partir dos ajustes no modelo AR(p) para dados em painel. O método de Ward foi o mais apropriado para a formação de grupos de genes com séries homogêneas. Uma vez obtidos esses grupos, é possível ajustar o modelo AR(2) para dados em painel e predizer a expressão gênica em um tempo futuro (135 min), a partir de um pequeno número de observações temporais (os outros nove valores de "fold-change").
653 $aBioinformática
653 $aMétodo de Tocher
653 $aMétodo de Ward
653 $aMicroarranjo
653 $aModelo autorregressivo
653 $aSérie temporal
700 1 $aSÁFADI, T.
700 1 $aSILVA, F. F. e.
773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília$gv. 46, n. 11, p. 1489-1495, nov. 2011.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Epagri-Sede (Epagri-Sede) |
|
|
Nenhum exemplar cadastrado para este documento. |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 46 | |
| 21. |  | VALMORBIDA, J.; WAMSER, A. F.; MONTEIRO, F. P.; LINS JÚNIOR, J. C.; MALLMANN, G.; HAHN, L. PRODUTIVIDADE DO TOMATEIRO NO SEGUNDO ANO DE CULTIVO NA MESMA ÁREA. In: CONGRESSO VIRTUAL DE AGRONOMIA, 11., 2023, Online. Anais... São Paulo: Convibra, 2023.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Epagri-Sede. |
|   |
| 22. | | MONTEIRO, F. P.; OGOSHI, C.; MALLMANN, G.; VALMORBIDA, J.; WAMSER, A. F.; LINS JÚNIOR, J. C. SOBREVIVÊNCIA DE TRICHODERMA HARZIANUM NAS FOLHAS DO TOMATEIRO. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL CIÊNCIA, SAÚDE E TERRITÓRIO, 7., 2023, Lages. Resumos... Lages: Uniplac, 2023.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Epagri-Sede. |
| |
| 23. | | MONTEIRO, F. P.; OGOSHI, C.; MALLMANN, G.; VALMORBIDA, J.; WAMSER, A. F.; LINS JÚNIOR, J. C. SOBREVIVÊNCIA DE TRICHODERMA HARZIANUM NO SOLO E SEU EFEITO NO CONTROLE DE DOENÇAS EM AMBIENTE DE ESTUFA. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL CIÊNCIA, SAÚDE E TERRITÓRIO, 7., 2023, Lages. Resumos... Lages: Uniplac, 2023.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Epagri-Sede. |
| |
| 25. | | MALLMANN, G.; VALMORBIDA, J.; WAMSER, A. F.; MONTEIRO, F. P.; LINS JÚNIOR, J. C.; FELTRIM, A. L. AVALIAÇÃO DO MODELO EPIDEMIOLÓGICO PARA A PREVISÃO DO OÍDIO DO MORANGUEIRO EM AMBIENTE PROTEGIDO. In: SEMINÁRIO NACIONAL SOBRE FRUTICULTURA DE CLIMA TEMPERADO, 15., 2023, São Joaquim, SC. Resumos... São Joaquim, SC: Epagri, 2023. p. 127| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Epagri-Sede. |
| |
| 26. | | WAMSER, A. F.; VALMORBIDA, J.; MALLMANN, G.; LINS JÚNIOR, J. C.; MONTEIRO, F. P.; SANTOS, J. P. PRODUÇÃO DO MORANGUEIRO CULTIVADO EM SUBSTRATO UTILIZANDO MANEJO AUTÔNOMO DA FERTIRRIGAÇÃO COM SENSORES IRRIGÁS. In: SEMINÁRIO NACIONAL SOBRE FRUTICULTURA DE CLIMA TEMPERADO, 15., 2023, São Joaquim, SC. Resumos... São Joaquim, SC: Epagri, 2023. p. 8| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Epagri-Sede. |
| |
| 27. | | VALMORBIDA, J.; WAMSER, A. F.; FELTRIM, A. L.; MONTEIRO, F. P.; MALLMANN, G.; LINS JÚNIOR, J. C. PRODUÇÃO DE TOMATE EM ESTUFA MODELO 'BANDEIRANTES' NA REGIÃO DE CAÇADOR, SC. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE CIÊNCIA, SAÚDE E TERRITÓRIO, 6., 2021, Lages, SC. Resumos... Lages, SC: Uniplac, 2021. p. 93| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Epagri-Sede. |
| |
| 28. | | MALLMANN, G.; MONTEIRO, F. P.; VALMORBIDA, J.; WAMSER, A. F.; LINS JÚNIOR, J. C.; FELTRIM, A. L. PANORAMA COMPARATIVO DOS AVISOS FITOSSANITÁRIOS NO TOMATEIRO NAS SAFRAS 2021/22 E 2022/23 EM CAÇADOR. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL CIÊNCIA, SAÚDE E TERRITÓRIO, 7., 2023, Lages, SC. Resumos... Lages, SC: Uniplac, 2023.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Epagri-Sede. |
| |
| 29. | | MALLMANN, G.; MONTEIRO, F. P.; VALMORBIDA, J.; WAMSER, A. F.; LINS JÚNIOR, J. C.; FELTRIM, A. L. AVALIAÇÃO DE SISTEMA DE ALERTA PARA DOENÇAS DE TOMATE EM AMBIENTE PROTEGIDO. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL CIÊNCIA, SAÚDE E TERRITÓRIO, 6., 2021, Online. Resumos... Lages, SC: Uniplac, 2021.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Epagri-Sede. |
| |
| 30. | | MALLMANN, G.; MONTEIRO, F. P.; LINS JÚNIOR, J. C.; VALMORBIDA, J.; WAMSER, A. F.; FELTRIM, A. L. AVISOS FITOSSANITÁRIOS DA FERRUGEM DO ALHO NAS SAFRAS 2021 E 2022 EM CAÇADOR-SC. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL CIÊNCIA, SAÚDE E TERRITÓRIO, 7., 2023, Lages, SC. Resumos... Lages, SC: Uniplac, 2023.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Epagri-Sede. |
| |
| 31. | | MONTEIRO, F. P.; OGOSHI, C.; CARDOSO, D. A.; PERAZOLLI, V.; PINTO, F. A. M. F.; MALLMANN, G. Development and validation of diagrammatic scales to assess septoriose in tomato. Plant Pathology and Quarentine, Guiyang, China, v. 11, n. 1, p. 115-124, 2021.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Epagri-Sede. |
| |
| 32. | | WAMSER, A. F.; VALMORBIDA, J.; MALLMANN, G.; LINS JÚNIOR, J. C.; MONTEIRO, F. P.; FELTRIM, A. L. Métodos de cultivo do tomateiro em estufa modelo 'bandeirantes', em Caçador, SC. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE OLERICULTURA, 56., 2022, Bento Gonçalves, RS. Resumos... Recife, PE: ABH, 2022.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Epagri-Sede. |
| |
| 33. | | WAMSER, A. F.; VALMORBIDA, J.; FELTRIM, A. L.; ARGENTA, L. C.; LINS JÚNIOR, J. C.; MALLMANN, G. Manejo da fertirrigação e condutividade elétrica da solução nutritiva na qualidade de frutos de tomate grape. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL CIÊNCIA, SAÚDE E TERRITÓRIO, 7., 2023, Lages, SC. Resumos... Lages, SC: Uniplac, 2023. p. 40| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Epagri-Sede. |
| |
| 34. | | LINS JÚNIOR, J. C.; VALMORBIDA, J.; WAMSER, A. F.; SANTOS, J. P.; MONTEIRO, F. P.; MALLMANN, G. Manejo de pragas em sistema de produção integrada de tomateiro tutorado. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL CIÊNCIA, SAÚDE E TERRITÓRIO, 6., 2021, Lages. Resumos... Lages: Uniplac, 2021. p. 80| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Epagri-Sede. |
| |
| 35. | | LINS JÚNIOR, J. C.; VALMORBIDA, J.; WAMSER, A. F.; SANTOS, J. P.; MALLMANN, G.; MONTEIRO, F. P. Flutuação populacional de pragas do tomateiro cultivado em estufa com e sem tela antiafídeo lateral. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL CIÊNCIA, SAÚDE E TERRITÓRIO, 6., 2021, Lages. Resumos... Lages: Uniplac, 2021. p. 68| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Epagri-Sede. |
| |
| 36. | | WAMSER, A. F.; VALMORBIDA, J.; MONTEIRO, F. P.; MALLMANN, G.; SANTOS, J. P.; LINS JÚNIOR, J. C. Fontes de adubo e manejos da fertirrigação no cultivo do morangueiro em substrato. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL CIÊNCIA, SAÚDE E TERRITÓRIO, 6., 2021, Lages. Resumos... Lages: Uniplac, 2021. p. 69| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Epagri-Sede. |
| |
| 37. | | LINS JÚNIOR, J. C.; VALMORBIDA, J.; WAMSER, A. F.; MALLMANN, G.; MONTEIRO, F. P.; HAHN, L.; SANTOS, J. P. Infestação da broca-pequena-do-tomateiro a campo e em estufa no sistema de produção integrada. In: CONGRESSO VIRTUAL DE AGRONOMIA, 11., 2023, Online. Anais... São Paulo, SP: Convibra, 2023.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Epagri-Sede. |
| |
| 38. | | VALMORBIDA, J.; WAMSER, A. F.; MONTEIRO, F. P.; MALLMANN, G.; SANTOS, J. P.; LINS JÚNIOR, J. C.; HAHN, L. Produtividade do tomate em diferentes manejos do solo e da planta. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE OLERICULTURA, 56., 2022, Bento Gonçalves. Resumos... Recife, PE: ABH, 2022.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Epagri-Sede. |
| |
| 39. | | MALLMANN, G.; FERNANDES, J. M.; MONTEIRO, F. P.; VALMORBIDA, J.; WAMSER, A. F.; LINS JÚNIOR, J. C. VALIDAÇÃO DE UM MODELO GENÉRICO PARA PREVISÃO DA FERRUGEM DO ALHO. In: SIMPOSIO INTERNACIONAL CIÊNCIA, SAÚDE E TERRITÓRIO, 6., 2021, Online. Resumos... Lages: Uniplac, 2021.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Epagri-Sede. |
| |
| 40. | | MALLMANN, G.; FERNANDES, J. M. C.; MONTEIRO, F. P.; WAMSER, A. F.; VALMORBIDA, J.; LINS JÚNIOR, J. C.; FELTRIM, A. L. AVALIAÇÃO DE PARÂMETROS EPIDEMIOLÓGICOS DA FERRUGEM DO ALHO. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 52., 2021, Online. Resumos... Brasília : Sociedade Brasileira de Fitopatologia, 2021. p. 415| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Epagri-Sede. |
| |
| Registros recuperados : 46 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
