Data/hora: 02/06/2024 11:10:36

Biblioteca(s): 	Epagri-Sede.	
Data corrente: 	19/03/2012	
Data da última atualização: 	19/03/2012	
Autoria: 	NASCIMENTO, M. ; SÁFADI, T.; SILVA, F. F. e.	
Título: 	Aplicação da análise de agrupamento de dados de expressão gênica temporal a dados em painel.	
Ano de publicação: 	2011	
Fonte/Imprenta: 	Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v. 46, n. 11, p. 1489-1495, nov. 2011.	
Idioma: 	Português	
Conteúdo: 	O objetivo deste trabalho foi determinar a melhor alternativa, entre os métodos de agrupamento hierárquico (Ward) e de otimização (Tocher), para a formação de grupos homogêneos de séries de expressão gênica, e realizar previsões quanto à expressão gênica dessas séries, a partir de pequeno número de observações temporais. Os dados utilizados referem-se à expressão de genes que atuam sobre o ciclo celular de Saccharomyces cerevisiae e corresponderam a 114 séries de expressão gênica, cada uma com dez valores de "fold-change" (medida da expressão gênica) ao longo do tempo (0, 15, 30, 45, 60, 75, 90, 105, 120 e 135 min). As estimativas dos parâmetros dos modelos autorregressivos AR(p) foram previamente ajustadas a séries individuais (de cada gene) de dados "microarray time series" e utilizadas, como variáveis, no processo de agrupamento. As previsões da expressão gênica foram feitas dentro de cada grupo formado, a partir dos ajustes no modelo AR(p) para dados em painel. O método de Ward foi o mais apropriado para a formação de grupos de genes com séries homogêneas. Uma vez obtidos esses grupos, é possível ajustar o modelo AR(2) para dados em painel e predizer a expressão gênica em um tempo futuro (135 min), a partir de um pequeno número de observações temporais (os outros nove valores de "fold-change").	
Palavras-Chave: 	Bioinformática; Método de Tocher; Método de Ward; Microarranjo; Modelo autorregressivo; Série temporal.	
Categoria do assunto: 	--	
Registro original: 	Epagri-Sede (Epagri-Sede)