Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Epagri-Sede. |
Data corrente: |
22/03/2012 |
Data da última atualização: |
22/03/2012 |
Autoria: |
FAVORETTO, P.; VEASEY, E. A.; MELO, P. C. T. de. |
Título: |
Molecular characterization of potato cultivars using SSR markers. |
Ano de publicação: |
2011 |
Fonte/Imprenta: |
Horticultura Brasileira, Brasília, v. 29, n. 4, p. 542-547, out./dez. 2011. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
A batata possui uma base genética estreita, sendo assim a utilização de marcadores moleculares é uma ferramenta muito importante no processo de caracterização de bancos de germoplasma e avaliação de divergência genética. O objetivo deste trabalho foi avaliar por meio de marcadores microssatélites ou Simple Sequence Repeats (SSR), 38 acessos de batata de duas coleções distintas contendo cultivares comerciais. Para a caracterização molecular foram analisados 10 loci, gerando um total de 46 alelos, os quais foram analisados como dados binários. Foi obtida uma matriz de similaridade utilizando o coeficiente de Jaccard e com o método aglomerativo UPGMA foi realizada uma análise de agrupamento pelo software NTSYSpc. Em média, o número de alelos por loco foi 4,6, variando de dois alelos para os iniciadores STM1049, STM1053 e STM1104 até 12 alelos por loco para o iniciador STM0019a. Dos 46 alelos identificados, apenas cinco foram monomórficos, observando-se, portanto, 89,1% de polimorfismo. O conteúdo de informação de polimorfismo (PIC) variou de 0,13 a 0,86, com média de 0,54. O coeficiente de similaridade de Jaccard variou de 0,41 a 0,93, mostrando a grande variabilidade genética entre os acessos. Observaram-se duas possíveis duplicatas [Atlantic (Canadá) e Atlantic (Chile), e Colorado e Ágata (EPAMIG) (duplicatas com estes SSRs, que não as separaram)]. Elevada similaridade foi também observada pelas cultivares Chipie e Melodie (EPAMIG), Voyager e Gourmandine (EPAMIG), Eole e Caesar (EPAMIG), e Cupido e Santé (Pirassu). Foram identificados também os acessos mais distantes geneticamente (Lady Rosetta e HPC-7B). MenosA batata possui uma base genética estreita, sendo assim a utilização de marcadores moleculares é uma ferramenta muito importante no processo de caracterização de bancos de germoplasma e avaliação de divergência genética. O objetivo deste trabalho foi avaliar por meio de marcadores microssatélites ou Simple Sequence Repeats (SSR), 38 acessos de batata de duas coleções distintas contendo cultivares comerciais. Para a caracterização molecular foram analisados 10 loci, gerando um total de 46 alelos, os quais foram analisados como dados binários. Foi obtida uma matriz de similaridade utilizando o coeficiente de Jaccard e com o método aglomerativo UPGMA foi realizada uma análise de agrupamento pelo software NTSYSpc. Em média, o número de alelos por loco foi 4,6, variando de dois alelos para os iniciadores STM1049, STM1053 e STM1104 até 12 alelos por loco para o iniciador STM0019a. Dos 46 alelos identificados, apenas cinco foram monomórficos, observando-se, portanto, 89,1% de polimorfismo. O conteúdo de informação de polimorfismo (PIC) variou de 0,13 a 0,86, com média de 0,54. O coeficiente de similaridade de Jaccard variou de 0,41 a 0,93, mostrando a grande variabilidade genética entre os acessos. Observaram-se duas possíveis duplicatas [Atlantic (Canadá) e Atlantic (Chile), e Colorado e Ágata (EPAMIG) (duplicatas com estes SSRs, que não as separaram)]. Elevada similaridade foi também observada pelas cultivares Chipie e Melodie (EPAMIG), Voyager e Gourmandine (EPAMIG), Eole e Caes... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Banco de germoplasma; Batata; Diversidade genética; Marcador molecular; Microssatélite; Solanum tuberosum. |
Categoria do assunto: |
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Marc: |
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