| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Epagri-Sede. |
|
Data corrente: |
27/05/2011 |
|
Data da última atualização: |
27/05/2011 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
ZACCARO, R. P.; CARARETOALVES, L. M.; TRAVENSOLO, R. F.; WICKERT, E.; LEMOS, E. G. M. |
|
Afiliação: |
Epagri |
|
Título: |
Utilização de marcador molecular SCAR na identificação de Fusarium subglutinans, agente causal da malformação da mangueira. |
|
Ano de publicação: |
2007 |
|
Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, SP, v. 29, n. 3, p. 563-570, 2007. |
|
Idioma: |
Português |
|
Notas: |
ISSN, 0100-2945 |
|
Conteúdo: |
O gênero Fusarium é responsável por doenças em diversas plantas economicamente importantes. Entre estas doenças, destaca-se a malformação da mangueira, causada pelo fungo Fusarium subglutinans. O objetivo deste trabalho foi desenvolver oligonucleotídeos iniciadores para reação em cadeia da polimerase (PCR), específicos para o fungo F. subglutinans da mangueira. A amplificação de DNA de oito Fusarium spp. de diferentes hospedeiros, usando o oligonucleotídeo randômico UBC-41 (TTAACCGGGG), produziu um fragmento de aproximadamente 1.300 pb somente para o fungo da mangueira. Tendo em vista que padrões de bandeamento por RAPD não são considerados confiáveis devido à baixa reprodutibilidade dos resultados, o fragmento diferencial foi eluído do gel de agarose, purificado, clonado e seqüenciado. As seqüências nucleotídicas foram utilizadas para identificar e sintetizar quatro pares de oligonucleotídeos específicos, denominados Fs 5, Fs 13, Fs 14 e Fs 15. DNAs de Fusarium spp. de outros hospedeiros (alho, amendoim, cana-de-açúcar, ciclâmen, ervilha, melão e trigo), da planta de mangueira cv. Tommy Atkins sadia e de outros cinco isolados de F. subglutinans de mangueira sintomática, foram submetidos à amplificação com os pares de oligonucleotídeos. Fragmentos amplificados foram visualizados somente para F. subglutinans de mangueira, demonstrando assim a especificidade dos oligonucleotídeos SCAR desenhados. |
|
Palavras-Chave: |
Mangifera indica; Marcador molecular; Oligonucleotídeo iniciador. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
|
|
|
Marc: |
LEADER 02027naa a2200169 a 4500
001 1076922
005 2011-05-27
008 2007 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aEpagri
245 $aUtilização de marcador molecular SCAR na identificação de Fusarium subglutinans, agente causal da malformação da mangueira.
260 $c2007
500 $aISSN, 0100-2945
520 $aO gênero Fusarium é responsável por doenças em diversas plantas economicamente importantes. Entre estas doenças, destaca-se a malformação da mangueira, causada pelo fungo Fusarium subglutinans. O objetivo deste trabalho foi desenvolver oligonucleotídeos iniciadores para reação em cadeia da polimerase (PCR), específicos para o fungo F. subglutinans da mangueira. A amplificação de DNA de oito Fusarium spp. de diferentes hospedeiros, usando o oligonucleotídeo randômico UBC-41 (TTAACCGGGG), produziu um fragmento de aproximadamente 1.300 pb somente para o fungo da mangueira. Tendo em vista que padrões de bandeamento por RAPD não são considerados confiáveis devido à baixa reprodutibilidade dos resultados, o fragmento diferencial foi eluído do gel de agarose, purificado, clonado e seqüenciado. As seqüências nucleotídicas foram utilizadas para identificar e sintetizar quatro pares de oligonucleotídeos específicos, denominados Fs 5, Fs 13, Fs 14 e Fs 15. DNAs de Fusarium spp. de outros hospedeiros (alho, amendoim, cana-de-açúcar, ciclâmen, ervilha, melão e trigo), da planta de mangueira cv. Tommy Atkins sadia e de outros cinco isolados de F. subglutinans de mangueira sintomática, foram submetidos à amplificação com os pares de oligonucleotídeos. Fragmentos amplificados foram visualizados somente para F. subglutinans de mangueira, demonstrando assim a especificidade dos oligonucleotídeos SCAR desenhados.
653 $aMangifera indica
653 $aMarcador molecular
653 $aOligonucleotídeo iniciador
773 $tRevista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, SP$gv. 29, n. 3, p. 563-570, 2007.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Epagri-Sede (Epagri-Sede) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
|
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Epagri-Sede. |
|
Data corrente: |
25/05/2011 |
|
Data da última atualização: |
25/05/2011 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Circulação/Nível: |
-- - -- |
|
Autoria: |
WICKERT, E.; LEMOS, E. G. M.; MACHADO, M. A. |
|
Afiliação: |
Epagri |
|
Título: |
Evaluation of the Genetic Diversity of Strains from Citrus and Coffee Hosts by SingleNucleotide Polymorphism Markers. |
|
Ano de publicação: |
2007 |
|
Fonte/Imprenta: |
Phytopathology, St. Paul, USA, v. 97, n. 12, p. 1543-1549, 2007. |
|
Idioma: |
Português |
|
Notas: |
ISSN, 0031-949X |
|
Conteúdo: |
The aim of this study was to obtain information about genetic diversity and make some inferences about the relationship of 27 strains of Xylella fastidiosa from different hosts and distinct geographical areas. Single-nucleotide polymorphism (SNP) molecular markers were identified in DNA sequences from 16 distinct regions of the genome of 24 strains of X. fastidiosa from coffee and citrus plants. Among the Brazilian strains, coffee-dependent strains have a greater number of SNPs (10 to 24 SNPs) than the citrus-based strains (2 to 12 SNPs); all the strains were compared with the sequenced strain 9a5c. The identified SNP markers were able to distinguish, for the first time, strains from citrus plants and coffee and showed that strains from coffee present higher genetic diversity than the others. These markers also have proven to be efficient for discriminating strains from the same host obtained from different geographic regions. X. fastidiosa, the causal agent of citrus variegated chlorosis, possesses genetic diversity, and the SNP markers were highly efficient for discriminating genetically close organisms. |
|
Palavras-Chave: |
SNP; Xylella fastidiosa. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
|
|
|
Marc: |
LEADER 01608naa a2200157 a 4500
001 1076835
005 2011-05-25
008 2007 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aEpagri
245 $aEvaluation of the Genetic Diversity of Strains from Citrus and Coffee Hosts by SingleNucleotide Polymorphism Markers.
260 $c2007
500 $aISSN, 0031-949X
520 $aThe aim of this study was to obtain information about genetic diversity and make some inferences about the relationship of 27 strains of Xylella fastidiosa from different hosts and distinct geographical areas. Single-nucleotide polymorphism (SNP) molecular markers were identified in DNA sequences from 16 distinct regions of the genome of 24 strains of X. fastidiosa from coffee and citrus plants. Among the Brazilian strains, coffee-dependent strains have a greater number of SNPs (10 to 24 SNPs) than the citrus-based strains (2 to 12 SNPs); all the strains were compared with the sequenced strain 9a5c. The identified SNP markers were able to distinguish, for the first time, strains from citrus plants and coffee and showed that strains from coffee present higher genetic diversity than the others. These markers also have proven to be efficient for discriminating strains from the same host obtained from different geographic regions. X. fastidiosa, the causal agent of citrus variegated chlorosis, possesses genetic diversity, and the SNP markers were highly efficient for discriminating genetically close organisms.
653 $aSNP
653 $aXylella fastidiosa
773 $tPhytopathology, St. Paul, USA$gv. 97, n. 12, p. 1543-1549, 2007.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Epagri-Sede (Epagri-Sede) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
