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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Epagri-Sede. |
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Data corrente: |
24/11/2021 |
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Data da última atualização: |
24/11/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SOUZA, M.; COMIN, J. J.; MORESCO, R.; MARASCHIN, M.; KURTZ, C.; LOVATO, P. E.; LOURENZI, C. R.; PILATTI, F. K.; LOSS, A.; KUHNEN, S. |
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Título: |
Exploratory and discriminant analysis of plant phenolic profiles obtained by UV?vis scanning spectroscopy. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Integrative Bioinformatics, Berlin, Alemanha, v. 18, p. 1-11, 2021. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Some species of cover crops produce phenolic compounds with allelopathic potential. The use of
math, statistical and computational tools to analyze data obtained with spectrophotometry can assist in the
chemical profle discrimination to choose which species and cultivation are the best for weed management
purposes. The aim of this study was to perform exploratory and discriminant analysis using R package
specmineonthephenolicprofleofSecalecerealeL.,AvenastrigosaL.andRaphanussativusL.shootsobtained
by UV?vis scanning spectrophotometry. Plants were collected at 60, 80 and 100 days after sowing and at 15
and 30 days after rolling in experiment in Brazil. Exploratory and discriminant analysis, namely principal
component analysis, hierarchical clustering analysis, t-test, fold-change, analysis of variance and supervised
machine learning analysis were performed. Results showed a stronger tendency to cluster phenolic profles
according to plant species rather than crop management system, period of sampling or plant phenologic
stage. PCA analysis showed a strong distinction of S. cereale L. and A. strigosa L. 30 days after rolling. Due
to the fast analysis and friendly use, the R package specmine can be recommended as a supporting tool to
exploratory and discriminatory analysis of multivariate data. |
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Palavras-Chave: |
chemometrics; cover crops; multivariate analysis; R language; specmine. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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Marc: |
LEADER 02143naa a2200289 a 4500
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520 $aSome species of cover crops produce phenolic compounds with allelopathic potential. The use of math, statistical and computational tools to analyze data obtained with spectrophotometry can assist in the chemical profle discrimination to choose which species and cultivation are the best for weed management purposes. The aim of this study was to perform exploratory and discriminant analysis using R package specmineonthephenolicprofleofSecalecerealeL.,AvenastrigosaL.andRaphanussativusL.shootsobtained by UV?vis scanning spectrophotometry. Plants were collected at 60, 80 and 100 days after sowing and at 15 and 30 days after rolling in experiment in Brazil. Exploratory and discriminant analysis, namely principal component analysis, hierarchical clustering analysis, t-test, fold-change, analysis of variance and supervised machine learning analysis were performed. Results showed a stronger tendency to cluster phenolic profles according to plant species rather than crop management system, period of sampling or plant phenologic stage. PCA analysis showed a strong distinction of S. cereale L. and A. strigosa L. 30 days after rolling. Due to the fast analysis and friendly use, the R package specmine can be recommended as a supporting tool to exploratory and discriminatory analysis of multivariate data.
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700 1 $aKUHNEN, S.
773 $tJournal of Integrative Bioinformatics, Berlin, Alemanha$gv. 18, p. 1-11, 2021.
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Registro original: |
Epagri-Sede (Epagri-Sede) |
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| Registros recuperados : 119 | |
| 61. |  | SOUZA, M.; COMIN, J. J.; LEGUIZAMÓN, E. S.; KURTZ, C.; BRUNETTO, G.; MÜLLER JÚNIOR, V.; VENTURA, B.; CAMARGO, A. P. Matéria seca de plantas de cobertura, produção de cebola e atributos químicos do solo em sistema plantio direto agroecológico. Ciência Rural, Santa Maria, n. 43, p. 21-27, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
| Biblioteca(s): Epagri-Sede. |
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| 62. | | LIMA, A. P.; OLIVEIRA, R. A.; KURTZ, C.; MORA, C.; GATIBONI, L. G.; COMIN, J. J.; KOUCHER, L. Monitoramento da Relação C/N de Resíduos de Plantas de Cobertura em Sistema de Plantio Direto de Cebola. In: REUNIÃO SUL-BRASILEIRA DE CIÊNCIA DO SOLO, 10., 2014, Pelotas, RS. ANAIS... PELOTAS, RS: SBCS-NRS, 2014. p. 1-4.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 63. | | SOUZA, M.; LEGUISAMON, E. S.; MÜLLER JÚNIOR, V.; VENTURA, B. S.; CAMARGO, A. P.; KURTZ, C.; COMIN, J. J. DINÂMICA DE EMERGÊNCIA DE PLANTAS ESPONTÂNEAS DURANTE O PERÍODO CRÍTICO DE DESENVOLVIMENTO DA CEBOLA SOB SISTEMA PLANTIO DIRETO. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 28., 2012, Campo Grande, MS. Anais... Campo Grande, MS: Sociedade Brasileira de Ciência das Plantas daninhas, 2012. p. 1-5.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 64. | | LENZ, G. L.; BORDALLO, S. U.; SANTOS, T. S.; CANTÚ, R. R.; SCHALLENBERGER, E.; COMIN, J. J. Estrutura do Solo e Matéria Orgânica Leve em Diferentes Sistemas de Manejo do Solo. In: REUNIÃO SUL BRASILEIRA DE CIÊNCIA DO SOLO, 12., 2018, Xanxerê. Anais... Xanxerê: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2018.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 65. | | DORTZBACH, D.; COUTO, R. R.; LEIS, C. M.; SARTOR, L. R.; BELLI FILHO, P.; COMIN, J. J. Estimativa de NPK do dejeto suíno e área de lavoura de soja e milho possível de ser adubada no Estado de Santa Catarina. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza, CE. Anais... Fortaleza, CE: SBCS, 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
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| 67. | | MÜLLER JÚNIOR, V.; SOUZA, M.; VENTURA, B. S.; CAMARGO, A. P.; VILANOVA, C.; KURTZ, C.; COMIN, J. J.; BRUNETTO, G. Interferência da Matéria Seca de Plantas de Cobertura sobre a Emergência de Plantas Espontâneas em Sistema de Plantio Direto de Cebola. In: FERTBIO 2012, ., 2012, Maceió, AL. Anais... Viçosa, MG: SBCS, 2012. p. 1-3.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 68. | | SANTOS, L. H.; LOSS, A.; LOURENZI, C. R.; SOUZA, M.; GONZATTO, R.; KURTZ, C.; BRUNETTO, G.; COMIN, J. J. Total nitrogen and humic substances in aggregates of soils with onion crops under no-tillage and conventional system. REVISTA COLOMBIANA DE CIENCIAS HORTÍCOLAS, Bogotá, Colombia, v. 12, n. 1, p. 166-174, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - B |
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| 69. | | LIZARELLI, H. F.; GIOVANETTI, L. K.; LANZENDORF, D. Z.; ZIMMERMANN, M. L. S.; KURTZ, C.; COMIN, J. J. TEOR NUTRICIONAL DE CEBOLA CULTIVADA EM SISTEMA DE PLANTIO DIRETO DE HORTALIÇAS. In: ENCONTRO TÉCNICO-CIENTÍFICO DO PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM RECURSOS GENÉTICOS VEGETAIS, 1., 2023, Florianópolis, SC. Resumos... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2023. p. 73| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 70. | | LIZARELLI, H. F.; GIOVANETTI, L. K.; LANZENDORF, D. Z.; ZIMMERMANN, M. L. S.; KURTZ, C.; COMIN, J. J. TEOR NUTRICIONAL DE PLANTAS DE COBERTURA DE INVERNO EM SISTEMA DE PLANTIO DIRETO DE CEBOLA. In: ENCONTRO TÉCNICO-CIENTÍFICO DO PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM RECURSOS GENÉTICOS VEGETAIS, 1., 2023, Florianópolis, SC. Resumos... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2023. p. 73| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 71. | | SCHMITT, D. E.; GUARDINI, R.; BENEDETT, L.; FREITAS NETO, A. H.; VEIGA, M.; BRUNETTO, G.; COMIN, J. J.; FERREIRA, F. P. Alteração de atributos físicos em solo submetido à aplicação de dejetos de suínos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 33., 2011, Uberlândia, MG. Resumos... Uberlândia, MG: UFU, 2011. p. 1-4.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 72. | | NICOLOSO, R. S.; AITA, C.; GIACOMINI, S. J.; CERETTA, C. A.; SPAGNOLLO, E.; CASSOL, P. C.; COMIN, J. J.; BRUNETTO, G. Adubos e Adubação Orgânica. In: Núcleo Regional Sul de Ciência do Solo. Manual de Calagem e Adubação para os Estados do Rio Grande do Sul e de Santa Catarina. 11. ed. Frederico Westphalen, RS: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo - Núcleo Regional Sul, 2016. p. 317-328.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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| 75. | | COMIN, J. J.; VILANOVA, C. C.; KURTZ, C.; MÜLLER JÚNIOR, V.; VENTURA, B. S.; REIS, M. S.; BRUNETTO, G.; LOVATO, P. E.; SOUZA, M. Avaliação fitossociológica de plantas invasoras em cultivo de cebola sob sistema plantio direto sem uso de agrotóxicos. Revista de la Facultad de Agronomía, Buenos Aires, v. 117, n. 2, p. 197-206, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
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| 77. | | VENTURA, B. S.; SOUZA, M.; MÜLLER JÚNIOR, V.; CAMARGO, A. P.; KURTZ, C.; COMIN, J. J.; BRUNETTO, G.; FAYAD, J. A. Produção de Cebola e Atributos Químicos do Solo em Sistema Plantio Direto Agroecológico. In: FERTBIO 2012, 30., 2012, Maceió, AL. Anais... Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2012. p. 1-4.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 78. | | SOUZA, M.; KURTZ, C.; COMIN, J. J.; LOVATO, P. E.; MULLER JÚNIOR, V.; TRAPP, T.; MARTINS, C. P.; SILVA, R. B. Produção de Cebola Durante Cinco Anos sob Sistema Plantio Direto Agroecológico. In: REUNIÃO SUL-BRASILEIRA DE CIÊNCIA DO SOLO, 10., 2014, Pelotas, RS. Anais... Pelotas, RS: SBCS-NRS, 2014. p. 1-3.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 80. | | BRUNETTO, G.; ROZANE, D. E.; NATALE, W.; HAHN, L.; ANDRADE, C. B.; MOURA-BUENO, J. M.; TRAPP, T.; COMIN, J. J. Predição de nutrientes em frutíferas como estratégia para racionalizar a fertilização. In: Nogueira, T. A. R.; Cherubin, M. R.; Pereira, A. P. A.; Tiecher, T. (Eds.) Tópicos em Ciência do Solo. Viçosa, MG: SBCS, 2023. p. 205-237| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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